1、特征不同
国画颜料的显著特点是不易褪色、色彩鲜艳。而水彩颜料透明度高，色彩重叠时，下面的颜色会透过来，且色彩鲜艳度不如彩色墨水。
2、分类不同
国画颜料一般为管装和颜料块，也有颜料粉的。水彩颜料一般有四种：干水彩颜料湿水彩颜料片管装膏状水彩颜料瓶装液体水彩颜料。
3、材质不同
国画颜料包括矿物颜料、植物颜料和化工颜料。矿物颜料有朱砂、朱磦、银朱、石黄 、雄黄（又称雄精）、石青、石绿、赭石、蛤粉、铅粉、泥金、泥银、钛白等，植物颜料有花青、藤黄、胭脂、洋红，还有化工颜料包括曙红、深红、大红、铬黄、天蓝。