一般跨省就医报销比例在30%-40%左右，下面以安徽省报销比例参考：
1、跨省市外住院治疗的，按照市内医疗机构类别起付线增加一倍，报销比例降低10%
2、省外医院住院治疗的，起付线按档次住院总费用的20%计算(最低为两千元，最高为一万)，报销比例为55%。若是未经转诊到外地住院治疗的，报销比例再降低10%。
安徽到上海异地就医报销比例
大概报50%左右。具体要看所就诊医院的级别等，一般来说住院级别越高，报销比例越低。详情可咨询你农合本上印的新农合管理部门的电话。
2017年安徽省参加新农合的参保人，因病情需要，经当地医院开具转院证明后，到上海市新农合定点医院就医的医疗费可以报销。报销比例参照省内三级医院的必须标准。